科技日报北京6月23日电(记者刘霞)以色列魏茨曼科学研究院科学家于新一期《天然》杂志发表文章称:他们使用基在酶事情道理的计较机新算法设计出高效人工合成酶。这类新型酶不仅能催化自然卵白质没法完成的化学反映,其效率更到达人工智能(AI)设计酶的100倍,标记着“按需定制”高效酶的新阶段行将到临。 ? 传统计较机算法辅助设计的酶往往效率低下,需要泯灭年夜量时间举行试验室优化。为冲破这一瓶颈,研究团队独辟蹊径,选择“肯普消弭”(一种触及从特定底物碳原子上移除了质子的非自然化学反映)作为验证案例。 团队网络自然酶数据作为基础素材,经由过程计较将卵白质序列分化成片断。这些片断颠末从头组合后,由算法按照原子举动模子筛选出最抱负的化学“骨架”。使人惊奇的是,算法推翻了原本认为酶的活性位点需要环状氨基酸的传统认知,计较显示非环状布局反而更高效,这一发明使催三木SEO-化效率得到显著晋升。 终极降生的合成酶与自然酶比拟,虽然氨基酸序列差异跨越140处,却揭示出相称高的催化效率。 研究团队坦言,今朝合成的卵白质布局仍比自然酶简朴。以光互助用要害酶rubisco为例,自然酶能经由过程繁杂变化催化多步反映,而这恰是团队下一步重点攻关标的目的。 已往十年,AI卵白质设计年夜行其道,但其事情机制重要模拟现有酶。比拟之下,新算法的事情机制是基在物理道理来构建酶。研究团队暗示,AI于处置惩罚某些卵白质设计时确凿无可替换,但对于在繁杂催化反映仍力有未逮。将来需要将两种要领上风互补,才能设计出更完善的酶。
经由过程算法设计的一种酶(白色)将底物(红色、黄色及蓝色)包裹在其活性位点内。图片来历:《天然》网站
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